Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WSCD1Q658N2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms