Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms