Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms