Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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