Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms