Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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