Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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