Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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