Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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