Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GABRA6Q16445 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms