Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms