Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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