Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTTNQ14247 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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