Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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