Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms