Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CAPSQ13938 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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