Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
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SHROOM2Q13796 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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SHROOM2Q13796 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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