Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1SQ13698 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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