Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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