Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms