Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms