Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAMK2BQ13554 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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