Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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