Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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