Protein–RNA interactions for Protein: Q13433

SLC39A6, Zinc transporter ZIP6, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A6Q13433 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC39A6Q13433 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC39A6Q13433 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms