Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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UBE2V1Q13404 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms