Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTGDRQ13258 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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