Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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