Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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