Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms