Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms