Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PUDPQ08623 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms