Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLP2Q06481 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms