Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP7AQ04656 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms