Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms