Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms