Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms