Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms