Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTUD4Q01804 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms