Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms