Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms