Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASIC1P78348 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASIC1P78348 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms