Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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