Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms