Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms