Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms