Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms