Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA2P51531 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms