Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RGS4P49798 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGS4P49798 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGS4P49798 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGS4P49798 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms