Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SRP9P49458 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRP9P49458 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRP9P49458 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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